Молекулярное моделирование — сложная сеть различных наук, находящее применение в нанотехнологии, в молекулярной биологии, квантовой химии и биотехнологии.
Молекулярное моделирование молодая, востребованная и бурно развивающаяся наука.
На сегодняшний день методы квантовой химии и молекулярной динамики получили широкое распространение в численном моделировании электронной и атомной структур сложных систем молекулярных, кристаллических и переходных размеров. Это связано с технологическим развитием соответствующего математического обеспечения. Сейчас в мире функционирует достаточно много современных вычислительных комплексов, реализующих методы квантовой химии и молекулярной динамики. Использование многих из этих методов обеспечивается программой Hyper Chem для молекулярного моделирования.
HyperChem — комплексный программный продукт, предназначенный для задач молекулярного моделирования. Он включает в себя программы, реализующие методы молекулярной механики, квантовой химии и молекулярной динамики. Силовые поля, которые могут использоваться в HyperChem — это ММ+ (на базе ММ2), Amber, OPLS и BIO+ (на базе CHARMM). Реализованы полуэмпирические методы: расширенный метод Хюккеля, CNDO, INDO, MINDO/3, MNDO, AM1, PM3, ZINDO/1, ZINDO/S, а также возможности проведения неэмпирических расчетов и по теории возмущений Меллера-Плессета второго порядка.
Расчет молекулы в HyperChem
HyperChem обладает развитыми средствами визуализации, которые могут использоваться как при подготовке входной информации (структуры молекулы), так и при анализе результатов, например, рассчитанных характеристик ИК- и УФ- спектров.
Расчётные методы оказывают неоценимую помощь в создании лекарственных средств. Молекулярное моделирование входит во все области знаний и находит себе применение, порой играя одну из главных ролей. Некоторые области химии немыслимы без молекулярного моделирования. В развитых странах моделирование является современным методом изучения микроструктур.
В настоящее время для изучения реакционной способности молекул используются приближения CNDO/2, MNDO, AM1, PM3.
Метод CNDO основан на приближении нулевого дифференциального перекрывания и поэтому является одним из простейших полуэмпирических методов. Из этого факта следуют ограничения применимости метода, который из-за обедненной расчетной схемы недостаточно корректно воспроизводит многие эффекты.
С появлением более совершенных версий полуэмпирических методов МО приближение CNDO все реже применяется на практике. Так, в версии 7 программного продукта МОРАС данный метод не представлен. Тем не менее, во многих случаях для быстрой оценки электронных параметров полезно использовать схему CNDO, так как вследствие резкого уменьшения количества рассчитываемых интегралов с помощью этого метода можно исследовать более сложные объекты. В целом CNDO/2 дает надежные результаты при расчете электронных распределений и свойств, зависящих от них.
Основным калибровочным параметром в CNDO является резонансный интеграл. Он подбирается так, чтобы относительный порядок энергетических уровней занятых МО и коэффициенты разложения МО в ЛKAO наилучшим образом совпали с расчетами ab initio соединений обучающей выборки.
Tutorial Hyperchem
Общим достоинством всех перечисленных версий является прежде всего сравнительно малое время расчетов и меньшие размеры занимаемой оперативной памяти по сравнению с более точными приближениями. Это дает возможность как для быстрой оценки исследуемых объектов, так и для изучения более сложных молекул, требующих длительного времени расчета и больших объемов оперативной памяти. В целом приближение CNDO хорошо описывает электростатические эффекты и полярность связи. CNDO/2 может применяться для расчета дипольных моментов и зарядов по схеме Малликена и оценки равновесной геометрии.
Недостатки приближения CNDO являются следствием усечения расчетной схемы, которая не учитывает взаимодействия между перекрываниями орбитальных зарядов. В результате многие эффекты не воспроизводятся.
Метод MNDO был разработан на основе более строгого и сложного приближения NDDO. Это позволило существенно улучшить результаты расчетов при решении многих задач. Длительное время метод рассматривался в качестве основного полуэмпирического метода квантовой химии. Его возможности позволили с достаточной степенью надежности рассчитывать физико-химические свойства, электронные структуры и реакционную способность множества молекулярных систем.
Преимущество заключается в быстродействии (по сравнению с неэмпирическими методами) программ, в которых реализована схема MNDO. Это позволяет применять ее для исследования все более сложных объектов. Недостатки связаны с тем, что точность метода не может превышать точность тех экспериментальных данных, по которым проводилась параметризация.
В схеме MNDO используются 3 вида параметров.
Во-первых, варьируемые параметры, значения которых определяют с помощью оптимизационной процедуры.
Во-вторых, одноцентровые двухэлектронные интегралы, оценивающиеся из спектроскопических данных.
В-третьих, ряд зависимых параметров, необходимых для расчета двухцентровых двухэлектронных интегралов, оценивающиеся с помощью эмпирических схем.
В настоящее время область применения метода MNDO достаточно изучена. Зная особенности расчетной схемы MNDO, его преимущества и недостатки можно с успехом применять метод для решения многих задач.
Хотя в целом метод MNDO имеет существенные преимущества перед СNDO, в некоторых случаях метод дает серьезные сбои. Это в первую очередь касается расчетов молекул с водородными связями, барьеров внутреннего вращения в -сопряженных системах и расчетов четырехчленных циклов. Поэтому в рамках метода MNDO были разработаны модифицированные варианты.
Для расчета характеристик систем с водородными связями были разработаны методы MNDO/Н и MNDO/М, которые лучше воспроизводят экспериментальные значения энергии водородных связей в комплексах.
Удовлетворительное описание водородных связей позволило широко использовать модифицированные варианты для исследования биологических объектов.
Таким образом, полуэмпирические квантовохимические методы можно использовать с большим практическим выходом для изучения реакционной способности различных химических соединений.
Достоинства метода MNDO
Недостатки метода MNDO
1. Быстродействующий метод, позволяющий изучать строение и свойства сложных молекул.
2. Учитывается ориентация р-орбиталей и правильно описывается отталкивание неподеленных электронных пар.
3. Значительное расширение круга доступных для расчета соединений.
4. Более корректное описание последовательности верхних молекулярных уровней.
5. Может использоваться для интерпретации фотоэлектронных спектров.
6. Преимущества проявляются в большей степени в расчетах более полярных молекул.
7. Удовлетворительно описывается строение радикалов, дает разумные результаты для катионов органических соединений.
8. Более точно рассчитываются валентные углы.
9. Более надежный расчет частот колебаний, протонных эффектов и электронного сродства.
10. При изучении химических реакций правильно описывается ППЭ и ПС.
1. Точность метода не может превышать точности экспериментальных данных.
2. Электронная корреляция учитывается дважды. Правильнее было бы внесение корреляционных поправок.
3. Недооцениваются эффекты взаимодействия через пространство.
4. Ограничения возможности расчета соединений третьего и более высоких периодов (в частности с SO и SO2-группами) вследствии пренебрежения d-орбиталями.
5. Некорректное описание водородных связей.
6. Неверен расчет барьеров внутреннего вращения в сопряженных молекулах.
7. Недооценивается энергия трехцентровых связей.
8. Неудовлетворительная оценка спиновых плотностей и констант сверхтонкого расщепления электронного парамагнитного резонанса.
9. Завышается стабильность радикалов.
10. Потенциалы ионизации атомов III периода с сильно выраженным S-характером завышены вследствие применения приближения замороженного остова.
11. Плохо воспроизводится спиновая плотность в радикалах.
12. Энтальпия одноатомных ионов может значительно отличаться от экспериментальных данных.
13. Ограниченная воспроизводимость свойств неорганических молекул. Ошибка расчета составляет для энтальпии — 10 ккал/моль, потенциала ионизации — 1 эВ, длин связей — 0,07
Источник: studbooks.net
5 quants / Лабораторный практикум Квантово-химическое моделирование соединений в пакете HyperChem Учебно-методическое пособие
Высшего профессионального образования «Кемеровский государственный университет» Кафедра экспериментальной физики Лабораторный практикум Квантово-химическое моделирование соединений в пакете HyperChem Учебно-методическое пособие
Кемерово 2013
I. ПАКЕТ КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКИХ РАСЧЕТОВ HYPERCHEM 1. Введение В настоящее время компьютерное моделирование методами квантовой химии и молекулярной динамики электронной и атомной структур молекулярных и кластерных систем переходных наноразмеров различной сложности получило широкое распространение. Квантово-химические методы с большой точностью, не прибегая к дорогостоящему эксперименту, позволяют не только рассчитать свойства отдельных молекулярных систем, но и выявлять общие закономерности, присущие классам соединений, обосновывать существующие закономерности, проводить корреляции [1-14].
Как известно, в основе квантово-химических расчетов лежит решение уравнения Шредингера. Однако даже для многоэлектронных атомов и тем более для многоатомных систем решение уравнения точным численным методом неприемлемо из-за очень большого расчетного времени. Точное решение невозможно даже для молекулы водорода.
Последовательное применение приближенного метода решения уравнений Хартри-Фока-Рутаана — метода самосогласованного поля (ССП) — для молекул, состоящих всего из нескольких атомов, может натолкнуться на непреодолимые вычислительные проблемы. По этой причине в квантовой химии значение приобретают полуэмпирические (приближенные) методы решения этого уравнения. Поиск путей решения уравнения Шредингера для молекул в рамках схемы ССП может идти по нескольким направлениям. В зависимости от степени приближения все квантово-химические методы можно разделить на неэмпирические (первопринципный ab initio (от лат. « от начала ») и функционала плотности), полуэмпириче- ские , эмпирические (группа методов молекулярной механики ) и методы молекулярной динамики . На сегодняшний день в мире существует много вычислительных комплексов и программных продуктов, в которых реализованы методы квантовой химии. Наиболее полный список программ с описанием возможностей представлен в работе [15]. Широко используются такие пакеты, как Gaussian ( www.gaussian.com ), Gamess ( www.msg.ameslab.gov/GAMESS ), ChemCraft, как средство визуа-
HyperChem . К сожалению, ab initio расчеты даже в базисе 3-21G требуют значительных ресурсов оперативной, общей памяти ЭВМ, большой мощности процессора. В настоящее время этот метод редко применяется для молекул или молекулярных фрагментов, содержащих более 10 атомов.
Самым несомненным преимуществом программы HyperChem является возможность наглядного изображения графической структуры молекулы (рис. 1.1) и изменение геометрических параметров при оптимизации системы в интерактивном режиме.
Также программа отличается возможностями визуализации полученных в результате расчетов: молекулярных орбиталей, относительной интенсивности электронных переходов, потенциалов в двумерном изображении и анимация колебательных мод. При изложении материала предполагалось, что читатель знаком с основами химического строения веществ, университетским курсом атомной физики, а также с базовыми основами квантовой механики и квантовой химии.
И хотя пособие ориентировано на студентов физиков, не специализирующихся на квантовой химии, квантовохимические программы нельзя использовать как некий «черный ящик», не понимая идеи и методы современной квантовой химии. Необходимо также отметить, что для успешного освоения программы пользователю потребуются базовые навыки работы в операционной системе Windows.
2. Использование графического режима в пакете HyperСhem 2.1. Рабочее окно HyperChem Главное окно программы HyperChem представлено на рис. 1.2. Окно программы, являющееся стандартным окном Windowsприложения, содержит строку названия, строку меню, панель инструментов, строку состояния и основное рабочее поле визуализации и построения, где находится текущая молекулярная система. Строка названия вверху экрана показывает имя файла, с которым Вы работаете. Если Вы работаете во вновь созданном файле, появляется имя untitled . А также здесь расположены кнопки управления окном, которые содержат команды, позволяющие менять размеры, перемещать, расширять и закрывать окно HyperChem .
Строка меню содержит имена ниспадающих списков команд основного HyperChem меню: File (Файл), Edit (Редактирование), Build (Построение объектов), Select ( Выделение), Display (Экран), Databases (Базы данных), Setup (Установки), Compute (Расчет), Annotations ( Подписи), Script (Сценарий), Cance l (Отмена), Help (По- мощь). Рис. 1.2.
Элементы рабочего окна HyperChem Панель инструментов Левая сторона строки инструментов содержит восемь кнопок инструментальных средств, которые Вы используете, чтобы построить, выбрать, отобразить, и переместить атом или молекулу 
. Правая сторона содержит набор стандартных кнопок 
, выполняющих типичные действия с файлами и объектами в Windowsприложениях. В рабочем поле отображаются все загружаемые или создаваемые исследователем структуры. По умолчанию рабочее поле имеет черный фон. При желании цвет фона можно изменить, например, на
более привычный белый, в пункте Preferences ( Настройки ) главного меню File ( Файл ). Строка состояния в нижней части экрана показывает в зависимости от режима работы программы текущую информацию, такую как количество атомов в молекуле, состояние, результаты вычисления или ход вычислительного процесса, энергию или величину градиента, длины выбранных связей или углов, подсказки и т.п. Когда Вы выбираете пункт меню, краткое описание пункта появляется в строке состояния.
В правом углу строки состояния высвечивается сокращенное название выбранного вычислительного алгоритма (метода расчета), который в данный момент используется программой. Принцип работы программы таков, что для конкретной молекулярной модели, загруженной в окне визуализации, можно решать однотипные задачи, например, минимизировать энергию молекулы, используя различные методы.
Выбор метода производится в пункте Setup основного меню. В частности, словосочетание Ab Initio в правом нижнем углу экрана на рис. 1.1 означает, что рабочим расчетным методом в данный момент является данный неэмпирический квантовохимический метод. На рисунке 1.2 выбран метод ММ+ . 2.2. Использование мыши и инструментов Работа в HyperChem по большей части происходит при помощи мыши.
Она используется следующим образом: 1. L-Нажатие — щелчок левой кнопкой мыши. 2. R-Нажатие — щелчок правой кнопкой мыши. Обычно, R- нажатие имеет противоположный эффект L-нажатию. 3. Двойное нажатие — быстрый двойной щелчок левой кнопкой мыши.
4. L-протяжка или R-протяжка — нажатие на левую или правую кнопку мыши, и перемещение, не отпуская кнопки (скольжение), курсора в новую позицию в рабочей области. 5. LR-протяжка — нажатие и удержание левой кнопки мыши, затем правой кнопки и перемещение курсора в новую позицию в рабочей области. 6. RL-протяжка — так же, как LR-протяжка, но вначале происходит нажатие правой кнопки мыши. Курсор мыши способен изменять форму. Чтобы это увидеть:
1. Нажмите левую клавишу на инструментальном изображении 
( Draw — рисовать ). 2. Переместите курсор в рабочую область. Курсор приобретает соответствующую форму: . 3. Укажите на инструментальное изображение 
( Select — выбор ) и нажмите левую клавишу. 4. Переместите курсор в рабочую область.
Он приобретает соответствующую форму: . Таким же образом изменяется форма курсора при выборе остальных шести кнопок строки инструментов. 
Rotate out of plane (XY-вращение, свободное 3-х мерное) 
Rotate in plane (Z-вращение, вращение в плоскости экрана) 
Translate (перемещение в плоскости экрана) 
Z-translate (перемещение в Z-направлении, вглубь экрана) 
Maghify/Shrink (масштабирование, увеличение / уменьшение) 
Z-clipping planes (отрезание в z плоскости) При указании мышкой на кнопку появляется всплывающая подсказка, указывающая назначение выбранной кнопки. 2.3. Открытие файла В программе HyperChem Вы можете работать с молекулами, полученными тремя различными способами: 1. Инструментальные средства дают возможность создать двухмерную ( 2D ) структуру молекулы и затем преобразовывает ее с помощью моделепостроителя HyperChem в трехмерный ( 3D ) вид (см. далее п. 3). 2. Последовательный выбор из базы данных HyperChem уже готовых остатков аминокислот и нуклеотидов (нуклеозидов) позволяет создать белки и нуклеиновые кислоты. 3. Чтение данных с диска из файла в виде набора атомных и молекулярных координат, которые были сохранены в HyperChem в собственном формате файла (файл с расширением HIN ) или в фор-
мате белкового банка данных Brookhaven Protein Data Bank (файл ENT ), а также в ряде других форматов. Для открытия HIN файла с молекулярной структурой: 1. Левой кнопки мыши ( L-нажатие ) откройте меню File. 2. В меню выберите Open (Открыть). 3. Появляется список файлов в диалоговом окне, среди которых необходимо выбрать нужный и открыть его L-нажатием кнопки Открыть . Рис. 1.3.
Диалог открытия файлов внутреннего формата HIN с примерами молекул из папки Samples Если файл, который Вы хотите увидеть, находится не в текущей директории Samples (встроенном в программу каталогесправочнике химический соединений), то просто измените директорию или диск. Чтобы появилась молекула фуллерена С 60 , как на рис. 1.4, выберите в директории Samples > Aromatic файл c60.hin . Вы можете также открывать файл двойным щелчком на имени файла. 2.4. Использование дисплейных установочных параметров HyperChem автоматически использует дисплейные установочные параметры с последнего сеанса работы. Выбрать или изменить дисплейные установочные параметры можно, используя команды пункта меню Display (Экран ).
Источник: studfile.net
Программа HyperChem
ПРОБЛЕМА
Одним из важнейших элементов химического исследования
является анализ геометрической структуры соединений. Эта
область науки получила название структурная химия.
Структурные формулы отражают связанность различных
атомов в молекуле друг с другом. Они не всегда позволяет
передать взаимосвязи между атомами, в связи с чем
возникает необходимость отображения структуры в виде
геометрического образа — задача визуализации структуры.
3. HyperChem
HYPERCHEM
Это одна из наиболее популярных программ, позволяющих решать
задачи редактирования структурных формул химических
соединений и визуализации.
HyperChem предназначена для проведения расчетов характеристик
молекул (электронных, термодинамических, спектральных и т.д.)
неэмпирическими и полуэмпирическими методами. Имеется
графический редактор, базы данных для построения пептидов,
белков, фрагментов ДНК, полимеров и пр.
4. Пользовательский интерфейс программы HyperChem
ПОЛЬЗОВАТЕЛЬСКИЙ ИНТЕРФЕЙС ПРОГРАММЫ HYPERCHEM
В главном окне программы можно выделить
несколько элементов. Вверху находится строка
названия файла, с которым вы работаете в
настоящий момент, а также кнопки
свертывания, развертывания и закрытия
программы. Непосредственно под этой
строкой расположены главное меню
программы и панель инструментов, где
собраны инструменты, необходимые для
создания и редактирования моделей
молекулярных структур. В нижнем левом углу
окна находится строка сообщений, в которой
отображается текущая информация (длины
связей, валентные углы, энергия и т.д.). В
нижнем правом – название текущего
вычислительного метода.
5. Главное меню программы
File (Файл). В пункте представлен набор
возможных действий по открытию,
сохранению, печати текущих файлов
подпункт
Edit (Редактирование). Содержит
инструменты для редактирования
отображаемых в рабочей области
моделей. Имеется возможность отмены
произведенных действий, удаления,
вставки, вырезания моделей,
копирования, вращения модели,
установки значений длин связей между
атомами, валентных и торсионных углов.
ГЛАВНОЕ МЕНЮ ПРОГРАММЫ
6. меню Build (Строить)
МЕНЮ BUILD (СТРОИТЬ)
В пункте меню Build собраны инструменты,
необходимые для построения в рабочей области
моделей молекул.
Среди наиболее важных: Explicit Hydrogens – при
добавлении к любому элементу новой связи на
свободном ее конце программа будет по умолчанию
ставить атом водорода.
7.
Default Element… вызвает таблицу элементов, в
которой задается тип необходимого в текущий
момент химического элемента.
8. Add Hydrogens и Add H MODEL BUILD
Выбор этих подпунктов — все
свободные связи программа
добавляет атомы водорода
и приводится к 3D виду.
9.
Подпункт Substitute Selected
H заменяет выделенный
атом водорода
определенной
группировкой, например,
метильной, фенильной,
ацетиленовой и прочее.
Сохранить заместитель
позволяет подпункт Save
Substituent.
10.
• Подпункты Set… позволяют установить, в частности,
пользовательские значения типа, массы, заряда.
• Подпункты Constrain… – задать значения длин связей,
валентных и торсионных углов.
11. Панель управления HyperChem
ПАНЕЛЬ УПРАВЛЕНИЯ HYPERCHEM
• Draw Создание атомов и молекул
• Select Удаление не нужных вариантов
• Translate Перемещать
• Rotate out-of-plane Внеплоскостное
вращение
• Z-Translate Перемещение по оси Z
• Rotate in-plane Вращение в одной плоскости
• Zoom Изменение масштаба
12.
ПОСТРОЕНИЕ МОДЕЛЕЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ
ИНСТРУМЕНТА DRAW
Создадим простую молекулу пропана.
Это можно сделать,
выбрав элемент углерода в качестве
интересующего элемента, а затем
используя инструмент «Рисование», чтобы
набросать каркас.
Длины связей будут установлены на
правильные значения на более позднем
этапе. В конце процесса экран должен
выглядеть следующим образом:
13. Следующим шагом является «добавить водород» в разделе «Build»
СЛЕДУЮЩИМ
ШАГОМ ЯВЛЯЕТСЯ
«ДОБАВИТЬ
ВОДОРОД» В
РАЗДЕЛЕ «BUILD»
14. шаг «Оптимизация геометрии» (в разделе «Вычислить»).
ШАГ «ОПТИМИЗАЦИЯ
ГЕОМЕТРИИ»
(В РАЗДЕЛЕ «ВЫЧИСЛИТЬ»).
ТУТ УСТАНАВЛИВАЮТСЯ ДЛИННЫ СВЯЗЕЙ
ПОСРЕДСТВОМ МИНИМИЗАЦИИ ЭНЕРГИИ
СТРУКТУРЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ
ВЫБРАННОГО СИЛОВОГО ПОЛЯ
15. Окончательная структура с минимизацией энергии
ОКОНЧАТЕЛЬНАЯ СТРУКТУРА С МИНИМИЗАЦИЕЙ ЭНЕРГИИ
16.
Можно «выбрать» конкретные
атомы с помощью кнопки.
Например, выбор первых двух
атомов углерода дает расстояние
связи
17. Можно получить график энергопотребления для изменения этого расстояния, выбрав «Вычислить» «Потенциал», в результате чего
МОЖНО ПОЛУЧИТЬ ГРАФИК
ЭНЕРГОПОТРЕБЛЕНИЯ ДЛЯ
ИЗМЕНЕНИЯ ЭТОГО
РАССТОЯНИЯ, ВЫБРАВ
«ВЫЧИСЛИТЬ»
«ПОТЕНЦИАЛ», В
РЕЗУЛЬТАТЕ ЧЕГО ПОЯВИТСЯ
ЭКРАН, ОПРЕДЕЛЯЮЩИЙ
ПРЕДЕЛЫ
18. Расчеты в программе HyperChem Полуэмпирические методы расчета
РАСЧЕТЫ В ПРОГРАММЕ HYPERCHEM
ПОЛУЭМПИРИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ РАСЧЕТА
Полуэмпирические методы расчета
можно использовать для всех типов
расчетов в пункте главного меню
Compute. Полуэмпирические
методы решают уравнение
Шредингера для атомов и молекул с
использованием определенных
приближений и упрощений.
В ПРОГРАММЕ HYPERCHEM
ПРЕДСТАВЛЕНО 12
ПОЛУЭМПИРИЧЕСКИХ МЕТОДОВ
19.
Все методы этой группы характеризуются тем, что
расчет ведется только для валентных электронов,
пренебрегаются интегралы определенных
взаимодействий, используются стандартные не
оптимизированные базисные функции
электронных орбиталей и используются некоторые
параметры, полученные в эксперименте.
Экспериментальные параметры
устраняют необходимость расчетов ряда величин и
корректируют ошибочные результаты
приближений. Полуэмпирические методы в
программе HyperChem могут обрабатывать не все
элементы таблицы Менделеева, а только те,
параметры которых внесены в файлы параметров.
20. Ab initio (неэмпирический метод Хартри – Фока)
AB INITIO (НЕЭМПИРИЧЕСКИЙ МЕТОД ХАРТРИ –
ФОКА)
Ab initio метод требует для своих
расчетов гораздо больше
вычислительных ресурсов, нежели
молекулярно-механические и
полуэмпирические методы.
Особенно это касается
оптимизации геометрии или
проведения молекулярнодинамических расчетов.
21.
Для оптимизации
геометрии рекомендуется на
начальном этапе использовать
молекулярную механику, затем –
один из полуэмпирических методов,
для того, чтобы получить более или
менее обоснованную
начальную геометрию. Однако для
ряда неорганических систем
молекулярно-механические
и полуэмпирические расчеты дают
некорректные результаты, поэтому
рекомендуется
использовать параметр Model Builder
, для того чтобы получить более или
менее подходящую
стартовую геометрию.
Диалоговое окно метода Ab Initio
22.
HyperChem чрезвычайно простая в использовании программа молекулярного моделир
ования, предназначенная для проведения расчетов характеристик молекул
неэмпирическими и полуэмпирическими методами.
Это популярное и хорошо известное решение для молекулярного моделиро
вания как для исследователей, так и для преподавателей и студентов. Он це
нится за быстрый доступ, который он предоставляет к широкому спектру мет
одов вычисления и визуализации.
Источник: ppt-online.org