Что за программа dicom

В этой статье описываются основные понятия DICOM и службы DICOM.

DICOM

DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) — это международный стандарт для передачи, хранения, извлечения, печати, обработки и отображения медицинской информации, а также является основным стандартом медицинской визуализации, принятым в сфере здравоохранения.

Служба DICOM

Служба DICOM — это управляемая служба в службах данных работоспособности Azure , которая используется для приема и сохранения объектов DICOM с несколькими тысячами изображений в секунду. Он упрощает обмен данными и передачу данных изображений с любыми системами или приложениями с поддержкой DICOMweb™ с помощью стандартных API DICOMweb, таких как Store (STOW-RS),Search (QIDO-RS) и Retrieve (WADO-RS). Она поддерживается управляемым предложением «платформа как услуга» (PaaS) в облаке с полным соответствием PHI , что позволяет отправлять данные PHI в службу DICOM и обмениваться ими через безопасные сети.

Как работать с DICOM

• Соответствие ТРЕБОВАНИЯМ PHI. Защитите PHI с помощью непревзойденной аналитики безопасности. Ваши данные изолированы в уникальной базе данных для каждого экземпляра API и защищены с помощью отработки отказа в нескольких регионах. Служба DICOM реализует многоуровневую, глубокую защиту и расширенную защиту от угроз для ваших данных.
• Расширенные теги запросов. Кроме того, индексируйте исследования DICOM, ряды и экземпляры как стандартных, так и частных тегов DICOM, расширяя список тегов, которые уже указаны в инструкции о соответствии DICOM.
• Канал изменений: доступ к упорядоченным, гарантированным, неизменяемым журналам только для чтения всех изменений, происходящих в службе DICOM. Клиентские приложения могут считывать эти журналы в любое время независимо, параллельно и в собственном темпе.
• DICOMcast. С помощью DICOMcast служба DICOM может внедрять метаданные DICOM в службу FHIR или сервер FHIR в качестве ресурса исследования изображений, что обеспечивает единый источник истины как для клинических данных, так и для метаданных изображений. Эта функция доступна в виде функции с открытым кодом, которая может быть размещена в Azure. Дополнительные сведения о развертывании DICOMcast.
• Доступность по регионам. Служба DICOM имеет широкий спектр доступности во многих регионах с защитой от отработки отказа в нескольких регионах и постоянно расширяется.
• Масштабируемость. Служба DICOM разработана в комплекте для поддержки различных уровней рабочих нагрузок в больнице, регионе, стране и глобальном масштабе без ущерба для характеристик производительности с помощью функций автомасштабирования.
• Доступ на основе ролей. Вы управляете своими данными. Управление доступом на основе ролей (RBAC) позволяет управлять хранением данных и доступом к ним. Обеспечивая повышенную безопасность и снижая административную нагрузку, вы определяете, кто имеет доступ к создаваемым наборам данных, на основе определений ролей, созданных для вашей среды.

Кроме того, проект сервера DICOM с открытым кодом постоянно отслеживается на наличие четности функций с управляемой службой, чтобы разработчики могли развертывать открытый код версию в виде набора контейнеров Docker для ускорения разработки и тестирования в своих средах, а также вносить вклад в потенциальные возможности управляемой службы в будущем.

Разбор МРТ. Инструкция к программе RadiAnt DICOM Viewer

Приложения для службы DICOM

Для эффективного лечения пациентов, исследования новых методов лечения, диагностики решений или предоставления эффективного обзора истории здоровья одного пациента организации должны интегрировать данные из нескольких источников. Одной из наиболее важных интеграций является клинические данные и данные визуализации. Служба DICOM позволяет безопасно хранить данные образов в облаке Майкрософт и размещать их вместе с данными EHR и Интернета вещей в одной подписке Azure.

FHIR™ становится важным стандартом для клинических данных и обеспечивает расширяемость для поддержки интеграции других типов данных напрямую или с помощью ссылок. С помощью службы DICOM организации могут хранить ссылки на данные изображений в FHIR™ и включать запросы, которые пересекают наборы данных для клинических и изображений. Это может включать множество различных сценариев, например:

• Резервное копирование изображений: исследовательские учреждения, клиники, центры визуализации, ветеринарные клиники, учреждения патологии, розничные торговцы, любая команда или организация могут использовать службу DICOM для резервного копирования своих изображений с неограниченным хранилищем и доступом. Кроме того, нет необходимости в деидентифицировать данные PHI, так как наша служба проверяется на соответствие PHI.
• Обмен изображениями и совместная работа. Мгновенное предоставление общего доступа к изображениям, поднабору образов в хранилище или всей библиотеке образов со связанными данными EHR или без них.
• Аварийное восстановление. Высокий уровень доступности — это характеристика устойчивости службы DICOM. Высокий уровень доступности реализуется на месте (в том же регионе, что и основная служба), проектируя его как компонент основной системы.
• Создание когорт для исследований: Часто через запросы для пациентов, которые соответствуют данным как в клинических, так и в системах визуализации, таких как эта (что вызвало усилия по интеграции данных FHIR™ и DICOM): «Дайте мне все лекарства, предписанные со всеми документами КТ и связанных с ними отчетов о радиологии для любого пациента старше 45 лет, который имел диагноз остеосаркомы в течение последних двух лет».
• Поиск результатов для аналогичных пациентов, чтобы понять варианты и планировать лечение: при предъявлении диагноза пациента врач может определить результаты и планы лечения для прошлых пациентов с аналогичным диагнозом, даже если они включают данные визуализации.
• Предоставление продольного просмотра пациента во время диагностики: радиологи, особенно телерадиологи, часто не имеют полного доступа к истории болезни пациента и связанным исследованиям изображений. Благодаря интеграции FHIR™ эти данные можно легко предоставить даже радиологам за пределами локальной сети организации.
• Закрытие цикла обратной связи с телерадиологами: в идеале радиолог имеет доступ к клиническим данным больницы, чтобы закрыть цикл обратной связи после принятия рекомендации. Однако для телерадиологов, это часто не так. Вместо этого они часто не могут закрыть цикл обратной связи после выполнения диагностики, так как у них нет доступа к данным пациента после первоначального чтения. При отсутствии (или ограниченном) доступе к клиническим результатам или результатам они не могут получить обратную связь, необходимую для улучшения своих навыков. Как выразился один телерадиолог: «Возьмите паратиреоид, например. Мы делаем больше, чем любая другая клиника в стране, и все же я должен просить и умоляет хирургов рассказать мне, что они на самом деле нашли. Из более чем 500 исследований, которые я делаю каждый месяц, я получаю прямую обратную связь только о трех или четырех». Благодаря интеграции с FHIR™ организация может легко создать инструмент, который будет предоставлять прямую обратную связь телерадиологам, помогая им оттачивать свои навыки и делать лучшие рекомендации в будущем.
• Закрытие цикла обратной связи для моделей искусственного интеллекта и машинного обучения. Модели машинного обучения лучше всего подходят, когда для улучшения моделей можно использовать реальные отзывы. Однако сторонние поставщики моделей машинного обучения редко получают отзывы, необходимые для улучшения своих моделей с течением времени. Например, один из независимого поставщика программного обеспечения выразился так: «Мы используем сочетание моделей машин и человеческих экспертов, чтобы рекомендовать план лечения для операции на сердце. Тем не менее, мы лишь редко получаем отзывы от врачей о том, насколько точным был наш план. Например, мы часто рекомендуем размер стентов. Мы хотели бы получить отзыв о том, был ли наш прогноз правильным, но единственный раз, когда мы слышим от клиентов, когда есть серьезная проблема с нашими рекомендациями». Как и в случае с отзывами телерадиологов, интеграция с FHIR™ позволяет организациям создать механизм для предоставления обратной связи в конвейере переобучения модели.

Развертывание службы DICOM в Azure

Службе DICOM требуется подписка Azure для настройки и запуска необходимых компонентов. Эти компоненты по умолчанию создаются в существующей или новой группе ресурсов Azure для упрощения управления. Кроме того, требуется учетная запись Azure Active Directory. Для каждого экземпляра службы DICOM мы создаем сочетание изолированного и мультитенантного ресурсов.

Сервер DICOM

Сервер медицинских образов для DICOM (далее называется сервером DICOM) — это открытый код сервер DICOM, который легко развертывается в Azure. Он обеспечивает взаимодействие на основе стандартов с любыми системами с поддержкой DICOMweb™ и внедряет метаданные DICOM на сервер FHIR для создания целостного представления данных о пациентах. См. раздел Сервер DICOM.

Итоги

В этой концептуальной статье представлены общие сведения о DICOM и службе DICOM.

Дальнейшие действия

Чтобы приступить к работе со службой DICOM, см. раздел

Дополнительные сведения об использовании СТАНДАРТНЫХ API DICOMweb™ со службой DICOM см. в разделе

FHIR® является зарегистрированным товарным знаком HL7 и используется с разрешения HL7.

Источник: learn.microsoft.com

Файл с расширением .dicom

Файл DICOM — изображение медицинского характера, сохраненное в формате DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine). Это отраслевой формат, являющийся стандартом для хранения и распространения медицинских снимков. Файл DICOM может содержать одно или несколько изображений, например, результаты МРТ или ультразвукового обследования, а также информацию о пациенте.

Формат DICOM поддерживает большинство производителей медицинского оборудования и разработчиков программного обеспечения для медицинских учреждений. Помимо расширения .dicom может использоваться сокращенное расширение .dcm. Для просмотра таких изображений подойдет совместимая с форматом DICOM программа, например, бесплатный графический редактор GIMP. Изображения DICOM также можно открыть в веб-браузере с помощью Jack Imaging.

Источник: open-file.ru

Программы для просмотра снимков КТ и МРТ

Большинство существующих на сегодняшний день изображений, полученных в ходе проведения КТ (компьютерная томография) и МРТ (магнитно-резонансная томография) исследований, хранятся и передаются с использованием стандарта DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine). Если медучреждением предусмотрена передача снимков пациентам, то последним может выдаваться компакт-диск с записанным на нем DICOM-файлом. Для просмотра содержимого этого диска потребуется программа, поддерживающая данный стандарт данных.

Особенности стандарта DICOM

DICOM-файлы являются, скорее, архивами, нежели изображениями. Они состоят из метаданных (информация о пациентах, исследованиях, медицинского учреждения, проводивших эти исследования, и ряд других сведений), и самих снимков, полученных в ходе медицинских диагностических процедур. В одном DICOM-файле может присутствовать одновременно большое количество снимков, точнее — серии снимков. Размер файла может достигать нескольких гигабайт и зависит он от количества и качества/разрешения/типа снимков.

Обычно такой архив с метаданными и изображениями сохраняется в виде файла с расширением «.DCM». Также возможно сохранение снимков и прилагаемых к ним данных проведенных исследований в виде пронумерованных файлов без какого-либо расширения. В этом случае также присутствует файл «DICOMDIR» (также без расширения), в котором хранятся пути к остальным файлам.

Сами же снимки — это обычные изображения, сохраненные (сжатые) с потерями (в основном JPG) и без потерь (TIFF или иной формат). Это объясняет возможность открытия DICOM-изображений при помощи приложений, вообще не имеющих отношения к медицине. Но все же их просмотр более удобен именно в специализированных программах.

Также отметим, что DICOM — это универсальный формат хранения медицинских данных, в котором распространяются далеко не только КТ и МРТ-снимки. Сюда также относятся снимки, полученные при помощи с ПЭТ-КТ (позитронно-эмиссионная томография), рентгеновских аппаратов, ультразвукового оборудования и т.д.

DICOM-файлы отличаются друг от друга типом (модальностью), который зависит от того, при помощи какого именно типа медицинского оборудования была проведена диагностика, каким образом были сжаты исходные снимки и других факторов.

По этому же признаку друг от друга отличаются и программы для просмотра снимков — они могут поддерживать или не поддерживать DICOM-файлы определенной модальности, иметь или не иметь инструменты для их редактирования, организации, подробного изучения.

RadiAnt DICOM Viewer

RadiAnt DICOM Viewer — программа, специализирующаяся исключительно на просмотре медицинских изображений стандарта DICOM. В течение 30 дней приложением можно пользоваться бесплатно без функциональных ограничений.

Поддерживаемые типы DICOM-изображений

Программа RadiAnt DICOM Viewer способна открывать, как DCM-файлы, так и папки с DICOM-изображениями, в т.ч. архивированными в ZIP-формат. Приложение поддерживает многие типы (модальности) DICOM-изображений, полученных в ходе проведения разных медицинских исследований. Помимо компьютерной (КТ) и магнитно-резонансной томографии (МРТ) сюда также относятся:

• Рентгенография (КР/ЦР)
• Гамма-камера, радионуклидная диагностика (РНД)
• Позитронно-эмиссионная томография (ПЭТ-КТ)
• Маммография (МГ)
• Ультразвуковая диагностика (УЗИ)
• Цифровая субтракционная ангиография (ЦСА)

RadiAnt DICOM Viewer поддерживает монохроматические и цветные, статические и динамические, сжатые и несжатые изображения. Таким образом, программа позволяет просматривать снимки, полученные практически с любого современного медоборудования и диагностических аппаратов предыдущих поколений.

Инструменты и функции RadiAnt DICOM Viewer

Приложение RadiAnt DICOM Viewer предоставляет пользователям следующий набор инструментов для работы с изображениями:

• Масштабирование и панорамирование.
• Поворот на 90 и 180 градусов, зеркалирование.
• Настройка яркости и контрастности.
• Просмотр в режиме «негатив».
• Различные измерительные инструменты: окружность и эллипс (площадь, плотность тканей в единицах Хаунсфилда), линейка (длина сегмента), транспортир (измерение нормальных углов и углов Кобба) и другие.
• Возможность рисования пером поверх изображений, размещение стрелок и полигональных линий (открытых и закрытых).

Из функциональных возможностей RadiAnt DICOM Viewer также отметим:

• Поддержка трехмерных снимков, полученных с современных КТ/МРТ сканеров.
• Возможность открытия нескольких DICOM-файлов в одном окне для удобного сравнения исследований.
• Автоматическая синхронизация серий изображений, полученных в одной плоскости.
• Создание локальной базы DICOM-изображений с возможностью текстового поиска по метаданным.
• Поиск и открытие DICOM-изображений на удаленных DICOM-серверах с использованием системы PACS.
• Экспорт DICOM в JPEG и BMP-изображения, а также видео формата WMV, состоящее из последовательно переключаемых снимков.
• Возможность записи на CD/DVD-диск специального модуля RadiAnt DICOM Viewer, позволяющего открывать содержимое прямо с носителя без необходимости установки программы на компьютер.

Это далеко не весь перечень функциональных возможностей программы RadiAnt DICOM Viewer.

MicroDicom Viewer

MicroDicom Viewer — бесплатная для некоммерческого использования программа, позволяющая не только открывать, но и создавать DICOM-файлы на основе отдельных изображений. Приложение имеет небольшой размер (5 Мб), в нем присутствуют наиболее востребованные инструменты для работы с изображениями DICOM, отличается интуитивно понятным пользовательским интерфейсом.

Основные функции MicroDicom Viewer

По части поддерживаемых MicroDicom Viewer типов DICOM-изображений программа является полным аналогом предыдущего приложения. Как и в случае с RadiAnt DICOM Viewer, в качестве исходных данных могут быть использованы файлы .DCM, папки с DICOM-снимками и метаданными, а также ZIP-архивы. Для удобства реализована функция быстрого считывания снимков с CD/DVD-дисков. Также имеется возможность установки на диск или USB-носитель портативной версии программы.

Из функциональных возможностей и особенностей MicroDicom Viewer отметим:

• Регулировка яркости и контрастности
• Открытие нескольких изображений в одном окне (в разных внутренних окнах).
• Масштабирование, панорамирование и прокрутка.
• Операции разворота и поворота.
• Инструменты для измерений и создания аннотаций/заметок — линейка, прямоугольник, эллипс, угол, стрелки, создание скрытых областей, размещение текста, углы Кобба, открытые и закрытые полигональные линии и др.
• Вычисление средних, медианных, минимальных и максимальных значений с отображением стандартных отклонений.
• Измерение плотности тканей в единицах Хаунсфилда.
• Специальная функция «Cine Loop» для отображения ультразвуковых или ангиографических изображений в реальном времени.
• Работа в полноэкранном режиме.
• Отображение и скрытие тегов DICOM выбранного изображения.
• Возможность отображения только избранных метатегов.
• Настраиваемые панели инструментов для повышения эффективности и производительности.
• Применение к изображениям фильтров — размытие, резкость, морфологическое преобразование и других.
• Экспорт DICOM в графические (JPEG, BMP, PNG, GIF и TIFF) и видео форматы (WMV, AVI).
• Экспорт метатегов из DICOM-файлов в табличный CSV-файл.
• Экспорт

Программа MicroDicom Viewer также может быть использована в качестве PACS-клиента для поиска и скачивания DICOM-изображений с удаленных серверов с использованием сетевых протоколов C-ECHO, C-FIND, C-MOVE, C-GET и C-STORE.

Pro Surgical 3D

Pro Surgical 3D — еще одна бесплатная программа, специализирующаяся на просмотре медицинских изображений, полученных с компьютерных и магнитно-резонансных томографов.

Pro Surgical 3D позволяет быстро просматривать снимки пациентов, упрощая рабочие процессы, которые связаны с исследованием 2D и 3D-снимков рентгеновской компьютерной томографии и МРТ. Лечащим врачам программа предоставляет различную информацию для разработки оптимальных планов лечения пациентов. А пациентам помогает лучше понять свое состояние здоровья и предлагаемые варианты лечения.

Из функциональных возможностей и особенностей программы отметим:

• Программа разработана в основном для просмотра DICOM-изображений с КТ и МРТ сканеров, но она также поддерживает распространенные форматы файлов, отличных от DICOM: NifTi (.nii), Visualization Toolkit (.vtk) и ANALYZE (.hdr).
• Возможность импорта DICOM с PACS (локальной и онлайн-базы), CD/DVD, USB и локального компьютера.
• Возможность загрузки DICOM-изображений в PACS напрямую с компакт-диска или локального компьютера.
• Простой в использовании поиск по метаданным пациентов.
• Выполнение 3D-реконструкции и объемной визуализации (3D-рендеринга).
• Многоплоскостная и косая нарезка.
• Мгновенное интерактивное извлечение поверхностей и экспорт в форматы STL и PLY.
• Простая анонимизация и деидентификация снимки пациентов.
• Регулировка яркости и контрастности изображений.
• Создание и сохранение скриншотов.
• Функция параллельной сравнительной оценки до- и послеоперационных сканирований.
• Наличие инструментов для выполнения различных измерений.

Sante DICOM Viewer Pro

Sante DICOM Viewer Pro — профессиональная программа для просмотра DICOM-изображений, анонимайзер, конвертер, PACS-клиент и мини PACS- сервер, инструмент для записи снимков исследований на CD/DVD со встроенным средством просмотра. Бесплатная версия программы позволяет только просматривать снимки в течение 90 дней.

По словам разработчиков, Sante DICOM Viewer Pro — это не просто «еще одна программа просмотра DICOM», построенная с использованием свободно доступных библиотек, таких как dcmtk, itk и vtk. В отличие от сотен других приложений для открытия DICOM-файлов, отличающихся друг от друга только внешним видом, это программный продукт с уникальными возможностями, спроектированный и разработанный с нуля с использованием самых передовых инструментов программирования.

Sante DICOM Viewer Pro необходим не только радиологам, но и любому специалисту, который в повседневной практике получает изображения пациентов из сотрудничающих лабораторий в формате DICOM.

Приложение Sante DICOM Viewer Pro имеет довольно обширный список функциональных возможностей, куда относятся:

• Поддержка всех модальностей и типов файлов стандарта DICOM 3.0.
• Полная поддержка DICOMDIR (просмотр, открытие, создание, редактирование, выбор изображения/серии для просмотра и/или переноса в другую папку).
• Встроенный анонимайзер (деидентификация данных пациента, что позволяет избежать проблем с регламентом GDPR 2016/679 ЕС).
• Параллельное сравнение исследований.
• Расширенные инструменты выбора области интереса: свободная рука, волшебная палочка, пипетка, прямоугольник, круг, эллипс, многоугольник и др.
• Инструменты измерения: расстояние, угол, угол почки, полилиния, площадь, объем.
• Статистический анализ ROI: количество пикселей, минимальное значение, максимальное значение, среднее значение, стандартное отклонение, площадь, объем.
• Синхронизированный просмотр кадров, синхронизированное окно уровней и поле зрения.
• Поддержка модуля калибровки области ультразвука (калиброванные ультразвуковые измерения).
• Интерполированное (плавное) масштабирование и расширенные инструменты масштабирования (например, динамическое масштабирование, окно масштабирования).
• Поиск файлов по критериям (имя пациента, идентификатор исследования и т. д.), тегам и значениям тегов в папках на жестком диске или компакт-диске.
• Фильтры обработки изображений: размытие, резкость, маски свертки, минимальная маска, максимальная маска, медианная маска и др.
• Ортогональная многоплоскостная реконструкция (MPR).
• Пакетное преобразование DICOM в форматы изображений (JPEG, TIFF, BMP, PNG и др.)
• Поддержка всех DICOM протоколов при использовании программы в качестве PACS-клиента: C-FIND SCU/SCP, C-MOVE SCU/SCP, C-STORE SCU/SCP, C-GET SCU/SCP и C-ECHO SCU/SCP.

MeVisLab

MeVisLab — профессиональная программа, созданная для проведения сложных медицинских исследований, в т.ч. и для изучения полученных с современного медицинского оборудования снимков и построенных им же 3D-моделей. Программа не предъявляет никаких требований к открываемым ею медицинским изображениям, т.к. она поддерживает любые их форматы, в т.ч. и DICOM, независимо от их типа (модальности). Приложением можно пользоваться бесплатно в некоммерческих целях.

MeVisLab представляет собой мощную модульную структуру для исследований и разработок в области обработки изображений с особым акцентом на медицинскую визуализацию. Это позволяет быстро интегрировать и тестировать новые алгоритмы, а также разрабатывать прототипы клинических приложений.

MeVisLab включает расширенные программные модули для сегментации, регистрации, волюметрии, а также количественного морфологического и функционального анализа. На основе MeVisLab реализовано несколько клинических прототипов, включая программные помощники для нейровизуализации, динамического анализа изображений, планирования операций и сердечно-сосудистого анализа. Другими словами, MeVisLab используется и для планирования операций на различных органах человека.

• Инструкции
• Лучшие программы
• Полезные советы

Источник: www.softsalad.ru