Интерпретатор ChemCraft ( http://www.chemcraftprog.com/ ) сочетает в себе как классические графические инструменты для подготовки исходной структуры, так и широкие возможности визуализация результатов расчетов программ GAMESS и Gaussian94-Gaussian03. Рабочее окно программы имеет следующий вид:
6 Несомненным удобством является возможность пошаговой визуализации рассчитываемой молекулы (например, можно отследить ход оптимизации или сканирование поверхности потенциальной энергии вдоль какой-либо из координат). Все этапы расчета представлены иерархически в левой части рабочего окна программы.
Также в виде графической информации могут быть представлены градиенты энергии на каждом шаге оптимизации, анализ заселенностей, заряды на атомах, спиновая плотность, валентность, порядки связей, дипольный момент, химические сдвиги ЯМР. Частоты валентных колебаний могут быть представлены в анимированном виде.
Широкие возможности программа предоставляет в области отображения молекулярных орбиталей. Существует возможность варьировать качество получаемых трехмерных моделей для экономии вычислительных затрат. На приведенной ниже иллюстрации изображена одна из молекулярных орбиталей фенилнитрозооксида: К недостаткам можно отнести отсутствие портированной в Linux версии ChemCraft. Программа распространяется на коммерческой основе.
Tutorial ChemCraft
19.2.2. ViewMol3D.
ViewMol3D ( http://redandr.tripod.com/vm3/ ) – это Windows-ориентиро- ванная свободно распространяемая программа, разработанная Андреем Рыжковым и Аркадием Антипиным для визуализации результатов квантовохимических расчетов. Рабочее окно программы имеет следующий вид:
7 К основным возможностям программы относятся визуализация частот валентных колебаний, сил, действующих на атомы, а также возможность пошаговой демонстрации хода оптимизации или сканирования поверхности потенциальной энергии. ViewMol3D отличается высокой скоростью работы и нетребовательностью к аппаратным ресурсам. Запуск приложения в среде Linux возможен с помощью эмулятора Wine.
Источник: studfile.net
Chemcraft
Chemcraft — графическое приложение для работы с трёхмерными (3D) моделями молекул, молекулярного моделирования, визуализации результатов квантовохимических расчётов.
Chemcraft является сервисным приложением, не выполняющим никаких собственных расчётов, но значительно облегчающее использование стандартных квантовохимических пакетов. В основном приложение ориентировано на визуализацию выходных файлов GAMESS и Gaussian.
GAMESS (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) — утилита из пакета вычислительной квантовой химии производящая расчёты при помощи многих методов вычислений.
Chemcraft How-to Series 1: Catalyzation
Gaussian — пакет утилит для расчёта структуры и свойств молекулярных систем в газовом и конденсированном состоянии, включающем большое разнообразие методов вычислительной химии, квантовой химии и молекулярного моделирования.
Chemcraft сочетает в себе большой набор функциональных возможностей с интуитивно понятным графическим интерфейсом позволяющим просматривать и анализировать результаты расчётов, также в состав приложения входят утилиты для подготовки новых заданий (для расчётов в квантовохимических пакетах).
Chemcraft поддерживает отображение трёхмерных изображений по декартовым координатам атомов, с возможностью просмотра или модификации люого геометрического параметра в молекуле (расстояния, угла и др). В состав приложения включены различные средства для конструирования молекул и модификации молекулярной геометрии с использованием стандартного набора молекулярных фрагментов, «перетаскиванием» атомов или фрагментов, придание молекул требуемой симметрии и многое другое.
Визуализация Chemcraft выходных файлов GAMESS (GAMESS-US и PCGamess/Firefly) и Gaussian включает просмотр отдельных геометрий из файла (оптимизированной структуры, геометрии отдельного шага оптимизации и др), поддерживается анимация колебаний и графическое представление градиента энергий, визуализация молекулярных орбиталей в виде изоповерхностей, отображение графика сходимости ССП и пр.
Chemcraft даёт возможность экспортировать визуализации в несколько форматов молекулярных и белковых структур (все форматы GAMESS и Gaussian), поддерживается экспорт высококачественных 32-битных изображений в различных графических стилях, поддерживается прямой экспорт изображений в текстовые процессоры, имеются вспомогательные утилиты для подготовки и автоматической генерации блоков для входных файлов (в том числе с нестандартными базисными наборами).
Chemcraft не требует никакого специального графического оборудования, аппаратного ускорения или вспомогательных графических библиотек, управление приложением ориентировано на использование мыши, частично поддерживается управление с клавиатуры, имеется подробная документация по работе с приложением (в том числе на русском).
Chemcraft коммерческое приложение, для бесплатного использования доступна 150-дневная демонстрационная версия (многим русскоязычным пользователям ключ предоставляется бесплатно).
Источник: zenway.ru
ChemCraft для Windows
ChemCraft — графическая программа для конструирования молекул и визуализации квантовохимических расчетов (GAMESS, Gaussian), предоставляющая удобный интерфейс для просмотра и анализа расчетных файлов и различные утилиты для подготовки новых заданий.
- Отображение 3-мерных изображений молекул по декартовым координатам атомов, с возможностью просмотра или модификации любого геометрического параметра в молекуле (расстояния, угла);
- Визуализация расчетных файлов GAMESS и Gaussian, включая просмотр отдельных геометрий из файла (оптимизированная структура, геометрия отдельного шага оптимизации и др.), анимацию мод колебаний, графическое представление градиента энергии, визуализацию молекулярных орбиталей в виде изоповерхностей, отображение графика сходимости ССП и др.;
- Различные средства для конструирования молекул и модификации молекулярной геометрии: использование стандартного набора молекулярных фрагментов, «перетаскивание» атомов или фрагментов с помощью мыши, придание молекуле требуемой симметрии, и другие возможности;
- Получение качественных 32-битных изображений молекул в различных графических стилях, содержащих требуемые обозначения (надписи, линии и др.), которые легко экспортируются в Word или другой текстовый редактор;
- Вспомогательные утилиты для подготовки входных файлов: визуальное конструирование Z-матрицы, автоматическая генерация блоков для входных файлов GAMESS с нестандартными базисными наборами.
ТОП-сегодня раздела «Химия»
Chemical Equation Expert — мощная программа для составления уравнений химических реакций и.
Reactor — программа моделирования сложных параллельно-последовательных химических реакций.
Таблица Менделеева — саморасширяющийся справочник по элементам Таблицы Менделеева. Программа представляет собой записную книжку и книгу для чтения одновременно.
Содержит подробную информацию об элементах таблицы. По каждому элементу выводятся такие.
Справочник по содержанию важнейших веществ в продуктах питания содержит информацию о.
Электронная школа — программный комплекс, состоящий из обновлённых версий программ «Химия» и «Экология».
Отзывы о программе ChemCraft
Отзывов о программе ChemCraft 1.6.310 пока нет, можете добавить.
Источник: www.softportal.com